Pierwsi współcześni osadnicy na ziemiach Sikkimu to przybyli z północnej Birmy i Assamu Lepczowie zwani także Rongpa.

Lepczowie byli animistami i pozostali nimi w dużej mierze po dziś dzień. Obecnie stanowią niespełna 20 % populacji Sikkimu. Inne grupy etniczne zasiedlające Sikkim to Bhutijowie (od XIII w.) oraz Magarowie i Szerpowie (od XVIII w.).

Najsilniejszą sikkimską dynastią jest rządząca od ponad 300 lat dynastia Namgyal założona w roku 1641 przez króla (chogyala) Phuntsoga.
W tych czasach królestwo obejmuje ziemie obecnego Sikkimu jak również wschodniego Nepalu, tybetańskiej Doliny Chumbi, Dardżyling i Kalimpong w dzisiejszych Indiach i bhutańską współcześnie Dolinę Ha.

Kolejni władcy to: Tensung Namgyal (1670-1700), Chador Namgyal (1700-1717), Gyurmed Namgyal (1717-1733), Phuntsog Namgyal (1733-1780), Tenzing Namgyal (1780-1793), Tsugphud Namgyal (1793-1864 !), Sidkeong Namgyal (1864-1874), Thutop Namgyal (1874-1914), Tashi Namgyal (1914-1963) i ostatni, ożeniony z Amerykanką Hope Cook, Palden Thondup Namgyal (1963-1975). Za czasów panowania Gyurmeda Namgyala w wyniku wojen z Bhutanem Sikkim traci południowe ziemie z Kalimpongiem włącznie. W 1780 roku wojska nepalskich Gurkhów zagarniają terytoria zachodnie. W roku 1835 Dardżyling przechodzi w ręce Brytyjczyków.

Te działania wywołują reakcję Tybetu, który wysyła swoje armie do Sikkimu. Brytyjczycy stawiają odpór temu najazdowi. Cały czas słabnie pozycja sikkimskich chogyalów.

W końcu w referendum 97% głosujących opowiada się za przyłączeniem do południowego sąsiada i od roku 1975 Sikkim jest jednym ze stanów Indii.